In Pixel Tactics 3 treten zwei Spieler in einem taktischen Kartenduell gegeneinander an. Jeder Spieler verfügt über ein Deck aus 25 Karten, aus dem er einen Anführer wählt. Die Fähigkeiten des Anführers beeinflussen die Strategie und Spielweise der restlichen Karten im Deck, wodurch das Spiel auf 25 verschiedene Arten spielbar ist. Das Spiel endet, sobald der Anführer eines Spielers besiegt ist.

Pixel Tactics nutzt Charaktere und Umgebungen aus der Welt von BattleCON: War of Indines, es handelt sich jedoch um ein eigenständiges Spiel. Das Spiel lässt sich mit Pixel Tactics 1 und Pixel Tactics 2 kombinieren.

Das Spiel ist auf Englisch.